La región que hoy se conoce bajo la denominación de Iguazú, y que comprende a los países de Argentina, Brasil y Paraguay, estuvo ocupada desde tiempos inmemoriales por la cultura guaraní. Los españoles descubrirían las majestuosas Cataratas recién a mediados del Siglo XVI, de la mano del explorador Alvar Nuñez Cabeza de Vaca que, en una travesía que lo llevaba desde Brasil hacia Asunción, se encontró con este paisaje de ensueño denominándolo Cataratas de Santa María.

Mucho tiempo después, en 1901, se consiguió abrir un camino desde Puerto Aguirre hasta las Cataratas, obra que fue posible gracias a una donación de dinero realizada por Victoria Aguirre con tal objeto. A partir de entonces comenzaron a desarrollarse en la zona las instituciones que luego constituirán el poblado.

Entre 1934 y 1935 se crea el Parque Nacional Iguazú, de cuya administración dependerá Puerto Aguirre hasta que en 1943 se independiza como comuna adquiriendo la denominación de Puerto Iguazú.