Puerto Esperanza se ubica en el noroeste de la Provincia de Misiones, a 45 kilómetros de la localidad de Eldorado (al sur). Hacia el norte, el Parque Nacional Iguazú dista a 53 kilómetros; al este, Bernardo de Irigoyen se encuentra luego de recorrer 165 kilómetros.

Desde la ciudad Capital de Posadas se arriba a Puerto Esperanza a través de la Ruta Nacional Nº 12, luego de recorrer 251 kilómetros. Este camino paralelo al Río Paraná va regalando las ciudades de Candelaria, Santa Ana, San Ignacio, Jardín América, Capioví, Puerto Rico, Garuhapé, El Alcázar, Caraguatay, Montecarlo, Eldorado y Colonia Victoria.

Para llegar a Puerto Esperanza desde el norte de la Provincia de Misiones se debe tomar la Ruta Nacional Nº 12 (desde Puerto Iguazú, pasando por Libertad y Wanda), ó la Ruta Provincial Nº 19 (desde Andresito).

La Ruta Nacional Nº 14 recorre el centro de la Provincia de Misiones de sur a norte y se comunica con la ciudad de Puerto Esperanza luego de atravesar algunas de las rutas provinciales (RP Nº 3, 4, 103, 6, 7, 8, 11, 16) que la unen a la Ruta Nacional Nº 12 que conduce al destino elegido. Con este recorrido se puede llegar desde Leandro N. Alem, Oberá, Campo Grande, Aristóbulo del Valle, 2 de Mayo, San Vicente, San Pedro y Tobuna.